MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 21033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019753	ACCCC	2	10	1435	1444	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_019753	TGA	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019753	TGCT	2	8	1620	1627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019753	TGA	2	6	2926	2931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019753	TTTG	2	8	2937	2944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019753	TGC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019753	AT	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019753	TACT	2	8	2976	2983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019753	ACTT	2	8	2986	2993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019753	CAA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019753	T	6	6	3037	3042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019753	CCA	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_019753	TTAA	2	8	3062	3069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019753	TC	3	6	3077	3082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019753	TAC	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019753	TA	3	6	3172	3177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019753	A	6	6	3185	3190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019753	AG	3	6	3307	3312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019753	A	6	6	4852	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019753	AT	3	6	4862	4867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019753	TTC	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019753	TAG	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019753	TAA	2	6	4922	4927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019753	AATGAT	2	12	4974	4985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019753	AGA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019753	AAT	2	6	5089	5094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019753	ATC	2	6	5105	5110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019753	GCA	2	6	5145	5150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019753	ATT	2	6	5343	5348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019753	TAC	2	6	5409	5414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019753	T	6	6	5415	5420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019753	TGA	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019753	TAG	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019753	CAA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019753	AT	3	6	5659	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019753	TGA	2	6	5739	5744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019753	ATA	2	6	5745	5750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019753	ATT	2	6	5977	5982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019753	A	7	7	5986	5992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019753	TTA	2	6	6011	6016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019753	AAG	2	6	6052	6057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019753	ACA	2	6	6113	6118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019753	TTC	2	6	6148	6153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019753	A	6	6	6233	6238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019753	A	7	7	6250	6256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019753	TA	4	8	6356	6363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019753	AAT	2	6	6409	6414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019753	AAG	2	6	6462	6467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019753	A	6	6	6489	6494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019753	AATT	2	8	6609	6616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019753	CAG	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019753	AT	3	6	6646	6651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019753	A	7	7	6666	6672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019753	ACAA	2	8	6676	6683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019753	CTG	2	6	6795	6800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019753	ATG	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019753	ATT	2	6	6878	6883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019753	TTA	2	6	6911	6916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019753	ATT	2	6	7047	7052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019753	AAG	2	6	7066	7071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019753	GAAAA	2	10	7082	7091	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019753	ATA	2	6	7109	7114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019753	AGA	2	6	7180	7185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019753	GAT	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019753	A	7	7	7222	7228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019753	TAA	2	6	7265	7270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019753	GT	3	6	7412	7417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019753	AGC	2	6	7420	7425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019753	AGA	2	6	7459	7464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019753	TCA	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019753	CCAA	2	8	7690	7697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019753	AGT	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019753	GAA	2	6	7863	7868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019753	TTA	2	6	7989	7994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019753	GAA	2	6	7995	8000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019753	GAA	2	6	8025	8030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019753	AAG	2	6	8044	8049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019753	AG	3	6	8115	8120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019753	CAA	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019753	CAA	2	6	8196	8201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019753	GCA	2	6	8219	8224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019753	ACA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019753	TCG	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019753	ACA	2	6	8300	8305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019753	AG	3	6	8336	8341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019753	A	6	6	8412	8417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019753	ACA	2	6	8481	8486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019753	TTG	2	6	8495	8500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019753	TCG	2	6	8520	8525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019753	ACA	2	6	8550	8555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019753	GAT	2	6	8587	8592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019753	TAA	2	6	8695	8700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019753	TA	3	6	8761	8766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019753	CTATT	2	10	8806	8815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019753	CT	3	6	8828	8833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019753	CCCT	2	8	8840	8847	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_019753	G	6	6	8859	8864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019753	G	6	6	8867	8872	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019753	ATTT	2	8	10083	10090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019753	ATTA	2	8	10498	10505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019753	ATAA	2	8	10527	10534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019753	GCT	2	6	10544	10549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019753	GTT	2	6	11163	11168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019753	CTG	2	6	11227	11232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019753	AATACT	2	12	11234	11245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019753	TTG	2	6	11265	11270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019753	AGG	2	6	11321	11326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019753	AAAAG	2	10	11334	11343	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019753	TGA	2	6	12668	12673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019753	TGG	2	6	12774	12779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019753	AGC	2	6	12806	12811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019753	T	6	6	12823	12828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019753	TAA	2	6	12926	12931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019753	A	6	6	13063	13068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019753	TGA	2	6	13133	13138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019753	GA	3	6	13173	13178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019753	ATAA	2	8	13229	13236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019753	A	6	6	13242	13247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019753	GCC	2	6	13408	13413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019753	TA	3	6	13425	13430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019753	TAG	2	6	15922	15927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019753	AAT	2	6	16046	16051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019753	AAT	2	6	16057	16062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019753	TTGG	2	8	16137	16144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019753	CTT	2	6	16152	16157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019753	TGC	2	6	16182	16187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019753	AAC	2	6	17244	17249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019753	GAG	2	6	17295	17300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019753	TTTA	2	8	17311	17318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019753	GA	3	6	17332	17337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019753	CTTC	2	8	18392	18399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019753	A	10	10	18434	18443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019753	ATT	2	6	18446	18451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019753	AAAT	2	8	18555	18562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019753	A	7	7	18571	18577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019753	A	6	6	20146	20151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019753	TAA	2	6	21218	21223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019753	AAGT	2	8	21224	21231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019753	T	6	6	21265	21270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019753	ATT	2	6	21716	21721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019753	TAT	2	6	21739	21744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019753	CTC	2	6	21748	21753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_019753	GTA	2	6	21771	21776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019753	T	6	6	21826	21831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019753	TTTAC	2	10	21859	21868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019753	TAT	3	9	22975	22983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019753	A	7	7	25529	25535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019753	TAG	2	6	25566	25571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019753	TAT	2	6	25622	25627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019753	GAT	2	6	25644	25649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019753	CT	3	6	25731	25736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_019753	AAT	2	6	25768	25773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019753	TGA	2	6	27354	27359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019753	AGT	2	6	27494	27499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019753	ATT	2	6	27515	27520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019753	T	7	7	27519	27525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019753	TTAG	2	8	27567	27574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_019753	TAAA	2	8	27836	27843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019753	ATA	2	6	27844	27849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019753	T	6	6	27905	27910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019753	AAT	2	6	27927	27932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_019753	A	8	8	29866	29873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019753	ATT	2	6	29938	29943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_019753	CAA	2	6	29963	29968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_019753	TAA	2	6	31667	31672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_019753	T	7	7	32185	32191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_019753	TAT	2	6	32227	32232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_019753	TGTT	2	8	36196	36203	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_019753	ATTA	2	8	46943	46950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_019753	AT	3	6	59363	59368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_019753	A	6	6	62017	62022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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